НОВОСТИ И ОБЪЯВЛЕНИЯ
03 мая 2018г.
Создан инструмент, превращающий символическую запись природных углеводов в оптимизированные атомные координаты
Сотрудником лаборатории стрессоустойчивости растений Иваном Юрьевичем Чернышовым совместно с исследователем из Института Органической Химии Тоукачем Филиппом Владимировичем создан инструмент, превращающий символическую запись природных углеводов в оптимизированные атомные координаты. В отличие от существующих аналогов, умеющих работать не более чем с 30-ю углеводными остатками, разработанный транслятор поддерживает около тысячи остатков, встречающихся в природных углеводах. Получаемые на выходе атомные координаты могут быть использованы в качестве стартовой геометрии для различных расчётов, включая предсказание спектров NOESY, молекулярный докинг и дизайн лекарств. Результаты исследования опубликованы в журнале Bioinformatics.
Chernyshov, I. Y. & Toukach, P. V. (2018). REStLESS: Automated Translation of Glycan Sequences from Residue-Based Notation to SMILES and Atomic Coordinates. Bioinformatics, 1, 1-3.