Биография Алексеева Якова Игоревича
Алексеев Яков Игоревич родился 31 августа 1971 года в г. Смоленск.
В 1987 году закончил физико-математический класс 7-ой средней школы имени Н.М.Пржевальского в г. Смоленск.
В 1993 году с отличием закончил Химический факультет Московского Государственного Университета имени М.В. Ломоносова, кафедра Химии природных соединений, лаборатория Химии нуклеиновых кислот.
В 1997 году вместе с выпускником химфака МГУ им. М.В. Ломоносова Кузубовым Алексеем Владимировичем на базе ВНИИ сельскохозяйственной биотехнологии Алексеев Я.И. основал научно-производственную компанию Синтол. В настоящее время Синтол является одним из ведущих российских биотехнологических предприятий.
В 2007 году Алексеев Я.И. возглавил лабораторию анализа генетически модифицированных организмов ВНИИСБ.
В 2009 году стал Руководителем созданного в институте центра коллективного пользования научным оборудованием ВНИИСБ «Биотехнология». Алексеев Я.И. является соавтором более тридцати научных публикаций, трех патентов на изобретение и трех полезных моделей.
В период с 2001 по настоящее время под руководством Алексеева Я.И. и при его непосредственном участии выполнено 29 научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ.
В 2003 — 2005 гг. Алексеев Я.И. участвовал в разработке первого отечественного прибора для ПЦР в реальном времени АНК. В настоящее время выпущено и работает как в России, так и за рубежом более 300 приборов.
В 2011 — 2012 гг. Алексеев Я.И. участвовал в разработке новой модели прибора для ПЦР в реальном времени АНК-48. В настоящее время Алексеев Я.И. участвует в проекте по созданию прибора АНК-96.
В 2011 — 2013 гг. Алексеев Я.И. руководил составной частью ОКР «Разработка генетического анализатора для секвенирования и фрагментного анализа ДНК», в результате которой разработан первый отечественный секвенатор ДНК НАНОФОР 05.
Приборы АНК и НАНОФОР 05 производятся серийно. Выпущено несколько сотен приборов, которые успешно работают в научно-исследовательских лабораториях, медицинских диагностических лабораториях, в центрах гигиены и эпидемиологии.
Прибор НАНОФОР 05 по техническим и потребительским характеристикам превосходит лучшие зарубежные аналоги. Секвенаторы работают в нескольких ведущих научно-исследовательских центрах.
В 2011-2014 гг. Алексеев Я.И. руководил составными частями НИОКР «Разработка комплекта молекулярно-биологических тест-систем для выявления, идентификации и генетического типирования патогенных биологических агентов» (шифр «Ворона») и «Разработка реагентов для выделения нуклеиновых кислот с целью их последующего анализа методами специфической индикации» (шифр «Соловей»). В результате выполнения работ разработаны и включены в Государственный оборонный заказ оборудование и тест-системы для специфической индикации опасных и особо опасных возбудителей инфекционных заболеваний.
Под руководством Алексеева Я.И. разработана технология синтеза и налажено серийное производство зондов для ПЦР в реальном времени. Разработаны технологии синтеза флуоресцентных красителей и гасителей флуоресценции, включая уникальные — RTQ (real-time quenchers). Разработана технология синтеза магнитных частиц, покрытых кремниевой оболочкой. Разработана технология синтеза полимера для секвенирования и фрагментного анализа ДНК (ПДМА-6).
В результате проведенных работ созданы и внедрены в практику:
первые отечественные приборы:
— для полимеразной цепной реакции в реальном времени — АНК.
— для расшифровки последовательности ДНК — НАНОФОР 05
— для автоматического выделения нуклеиновых кислот на магнитных частицах — УВДНК, КВНК.
отечественные технологии:
— «АмплиТуб» — не имеющая мировых аналогов технология быстрого выявления, количественного анализа ДНК микобактерии туберкулеза и определения её чувствительности к антибиотикам первого и второго ряда методом ПЦР в реальном времени
— «ГМО-скрин/количество/идентификация» — технология быстрого выявления и количественногоанализа ДНК всех разрешенных для применения в продуктах питания и кормах линий генетически модифицированных растений возбудителей заболеваний растений методом ПЦР в реальном времени
— «Фитоскрин» — технология быстрого выявления ДНК и РНК двадцати двух возбудителей заболеваний растений методом ПЦР в реальном времени
— «ОМ-скрин» — не имеющая мировых аналогов технология быстрого выявления ДНК и РНК двадцати пяти возбудителей опасных и особо опасных заболеваний методом ПЦР в реальном времени
Технология «АмплиТуб» внедрена более чем в 50 противотуберкулезных учреждениях по всей России.
Алексеев Я.И. имеет опыт руководства научно-производственным коллективом из 70 человек. Женат. Супруга — Беленович Екатерина Владимировна (выпускница Биологического факультета МГУ им. М.В. Ломоносова). Дети — дочери Александра (15 лет), Софья (12 лет) и Евдокия (7 лет).
23 сентября 2015 года приказом ФАНО № 812 п/о Алексеев Я.И. назначен временно исполняющим обязанности директора ФГБНУ ВНИИСБ.
Список публикаций и патентов:
1. Н.Ф.Крынецкая, Я.И.Алексеев, В.М.Белков, Х.К.Х.Ибрагим, В.Н.Ташлитцкий, Т.С.Орецкая, З.А.Шабарова Взаимодействие РНКазы Н из E.coli с модифицированными дуплексами. I Дуплексы, содержащие модификацию в углеводном остове. Биоорган. Химия, т.20, № 11, 1218-1226, 1994.
2. Я.И.Алексеев, М.Б.Готтих, Е.А.Романова, З.А.Шабарова Взаимодействие РНКазы Н из E.coli с модифицированными дуплексами. II Дуплексы, содержащие олиго(1-b-D-2’-дезокси-трео-пентофуранозил)тимидилат. Мол.Биология, т.30, № 2, 348-352, 1996.
3. Y.I.Alekseev, N.F.Krynetskaya, V.N.Tashlytsky, T.S.Oretskaya, N.G.Dolinnaya, F.Morvan, B.Rayner, C.Malvy, Z.A.ShabarovaInteractionofEsherichiaColiRibonuclease H withHybridDuplexesContaining 2’-Deoxyxylothymidine, 2’-Deoxy-2’-Fluorouridine orAlpha-Thymidine. Nucleosides&Nucleotides, V.15, № 9, 1545-1558, 1996.
4. Ilya Shilov, Vadim Tashlitsky, Marat Khodoun, Sergei Vasil’ev, Yakov Alekseev, Alexey Kuzubov, Elena Kubareva and Anna Karyagina. DNA-methyltransferaseSsoII interaction with own promoter region binding site. Nucleic Acids Research, Vol.26, No.11, 2659-2664, 1998.
5. Gottikh M.B., Alekseev Y.I., Perminov A.V., Pinskaya M.D., Shabarova Z.A. Oligodeoxyxylonucleotides form stable triplexes with single- DNA fragments. Nucleosides&Nucleotides, V.18, № 6&7, 1625-1627, 1999.
6. Geininaguenaud F., Liquier J., Brevnov M.G. Petrauskene O.V. AlexeevYa.I.Gromova E.S., Taillander M. Self-associated structures formed by T,C-rich sequences at acidic pH.Biochemistry 2000, V.39, N.41, pp.12650-12658.
7. Petrauskene O.V., Yakovleva Y.N., AlexeevYa.I., Strubach F.V., Babkina O.V., Gromova E.S.DNA duplexes contaning altered sugar residues as probes of EcoRII and MvaIendonuclease interactions with sugar phosphate backbone. J.Biomol.Struct.Dynamics, 2000, V.18, N.5, pp. 857-870.
8. Ю.Ю.Агапкина, Д.В. Агапкин, А.В. Загородников, Я.И. Алексеев, Г.А. Коршунова, М.Б. Готтих. Синтез олигонуклеотидных производных, содержащих 1-(4-(3-(трифторметил)-3Н-диазирин-3ил)бензамидо)-2,3-пропандиол, для фотоаффинной модификации белков и нуклеиновых кислот, Биоорганическая химия, 2002, том 28, № 4, с. 324-331
9. Якимович О.Ю., Алексеев Я.И., Воронина О.Л., Колобова О.С., Анисимова С.C., Лунин В.Г..HotStart (Горячий старт) полимеразной цепной реакции при помощи ДНК-лиганда. //Биотехнология. —2002.-Т.6. -С.57-59.
10. Ivanov S, Alekseev Y, Bertrand JR, Malvy C, Gottikh MB. Formation of stable triplexes between purine RNA and pyrimidine oligodeoxyxylonucleotides. Nucleic Acids Res.2003 Jul 15;31(14):4256-63.
11. Yakimovich OY, Alekseev YI, Maksimenko AV, Voronina OL, Lunin VG. Influence of DNA aptamer structure on the specificity of binding to Taq DNA polymerase. Biochemistry (Mosc).2003 Feb;68(2):228-35.
12. A.A.Evstrapov, A.L.Bulyanitsa, V.E.Kurochkin, A.O.Petryakov, G.E.Rudnitskaya, T.A.Sal’nikova, Ya.I.Alekseev Rapid analysis of oligonucleotides on a planar microfluidic chip, Journal of Analitical Chemistry (Rus), Vol.59, No.6, 2004, pp. 521-527.
13. Я. И. Алексеев, Ю. В. Белов, Д. А. Варламов, С. В. Коновалов, В. Е. Курочкин, Н. Ф. Маракушин, А. И. Петров, А. О. Петряков, Д. А. Румянцев, Е. Ю. Скоблилов, В. Н. Соколов, В. А. Фесенко, А. В. Чернышев ПРИБОРЫ ДЛЯ ДИАГНОСТИКИ БИОЛОГИЧЕСКИХ ОБЪЕКТОВ НА ОСНОВЕ МЕТОДА ПОЛИМЕРАЗНОЙ ЦЕПНОЙ РЕАКЦИИ В РЕАЛЬНОМ ВРЕМЕНИ (ПЦР-РВ) Научное приборостроение 2006, том 16 № 3 Стр. 132–136.
14. Гудов В.П., Алексеев Я.И., Варламов Д.А., Лунин В.Г., Харченко П.Н. Разработка подхода эффективного планирования флуоресцентно-меченых зондов для ПЦР в реальном времени. Доклады РАСХН, 2007 год, № 6, стр. 7-11.
15. М.А.Владимирский, Ю.С.Аляпкина, Д.А.Варламов, Я.И.Алексеев, Л.К.Шипина, М.В.Шульгтна, Л.В.Домотенко, К.Р.Быкадорова, Н.Н.Гащенко, Л.Б.Ендоурова, О.В.Иванова, Е.А.Ильина, О.А.Левкова, Т.В.Макарова, В.И.Наземцева, Е.И.Павлова, А.Н.Полозов, И.В.Шишкина. Применение метода ПЦР в реальном времени для определения и контроля за распространением лекарственно-устойчивых штаммов микобактерий туберкулеза. Проблемы туберкулёза и болезней лёгких, 2008, № 4, стр. 32-44
16. Ю.С.Аляпкина, Ю.Е.Доронина, Т.И.Карпова, Ю.П.Пашко, Д.А.Варламов, Я.И.Алексеев, Ю.М.Романова, И.С.Тартаковский Применение ПЦР в реальном времени для выявления легоинелл в объектах окружающей среды. Журнал микробиологии, 2009, № 2, с. 75-80
17. Четверин А.Б., Фалалеева М.В., Четверина Е.В., Алексеев Я.И. Способ повышения специфичности обратной транскрирпции. Патент на изобретение № 2459872 от 10 апреля 2010 года.
18. М.И.Лапенков, Н.В.Плахина, Я.И.Алексеев, Д.А.Варламов Разработка тест-системы для количественной и качественной оценки содержания ДНК в криминалистических образцах методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Судебно-медицинская экспертиза, 2, 2011, с. 34-38.
19. М.И.Лапенков, Н.В.Плахина, Т.Л.Николаева, Я.И.Алексеев, Д.А.Варламов Определение RhD-антигена системы резус методом полимеразной цепной реакции в реальном времени. Судебно-медицинская экспертиза, 4, 2011, с.15-18.
20. Малюченко О.П., Алексеев Я.И., Монахова Ю.А., Марзанова С.Н., Марзанов Н.С., Изучение молекулярной изменчивости генов плодовитости BMP15 и GDF9 у Романовской породы овец. Известия ТСХА, выпуск 6, 2011, с.167-169.
21. Я.И.Алексеев, Т.В.Хотяинцева, С.В.Боровская, О.С.Колобова, Д.А.Варламов, П.Н.Харченко, 35S промотор вируса норичника (P-FMV) — новая мишень для анализа на содержание генетически модифицированных организмов. Известия ТСХА, выпуск 6, 2011, с.156-161.
22. А.Г. Глоба, Я.И.Алексеев, Д.А.Варламов, А.А.Вишневский, Оценка диагностической значимости РНК-онкомаркеров при злокачественных образованиях молочной железы, Биомедицинская химия, 2011, том 57, вып. 6, с. 677-680
23. Эйдельштейн М.В., Алексеев Я.И., Никулин А.А., Романов А.В., Козлов Р.С., Способ детекции специфических нуклеотидных последовательностей и нуклеотидных замен с помощью ПЦР в режиме реального времени с эффектом гашения флуоресценции зонда праймером. Патент на изобретение № 2451086 от 20 мая 2012 года.
24. Супрун И.И., Алексеев Я.И., Малюченко О.П., Бабаков А.В., Ушакова Я.В. Генотипирование подвоев яблони отечественной селекции с использованием мультиплексного STR-анализа. Садоводство и виноградарство № 4, 2012, с. 20-22.
25. Глоба А.Г., Алексеев Я.И., Арзуманян В.Г., Заборова В.А., Гуридов А.А. Использование метода ПЦР реального времени для количественного определения нескольких видов пропионовых бактерий, обитающих на коже человека. Биомедицинская химия, 2012, т. 58, вып. 5, с. 608-612
26. Алексеев Я.И., Белов Ю.В., Малюченко О.П. и др. Генетический анализатор для фрагментного анализа ДНК // Научное приборостроение. 2012. Т. 22, № 4. С. 86–92.
27. Алексеев Я.И., Боровская С.В., Колобова О.С., Д.А. Варламов, П.Н.Харченко, О.И. Пашкевич. Обнаружение генетически модифицированного рапса методом мультиплексной полимеразной цепной реакции, Вестник Российской академии сельскохозяйственных наук, 2013, № 4, с. 33 −37.
28. В.К. Швидченко, В.Т. Хасанов, М.А.Фида, Б.Бейсембина, П.Н.Харченко, Я.И.Алексеев, К.А.Благодатских, А.С.Казанцев, Н.Ю.Минакова Сравнение методов иммунофоерменого анализа и ПЦР в реальном времени для диагностики зараженности сортообразцовкартофеля вирусами, Вестник Российской академии сельскохозяйственных наук, 2014, № 2, с. 47 −49.
29. Алексеев Я.И., Белов Д.А., Белов Ю.В., Курочкин В.Е. Исследование погрешностей оцифровки пиков генетического анализатора // Научное приборостроение. 2014. Т.24 , № 2. С. 79-85.
30. D. V. Kapustin, A. I. Prostyakova1, Ya. I. Alexeev, D. A. Varlamov, V. P. Zubov, S. K. Zavriev «High-throughput Method of One-Step DNA Isolation for PCR Diagnostics of Mycobacterium tuberculosis», Acta Naturae, 2014, VOL. 6 № 2 (21).
31. 30. M. P. Beketova, E. A. Sokolova, O. P. Malyuchenko, Ya. I. Alekseev, M. A. Kuznetsova, B. E. Kozlovsky, E. V. Rogozina, and E. E. Khavkin «On Molecular Identification of Phytophthorainfestans Genotypes», Russian Agricultural Sciences, 2014, Vol. 40, No. 6, pp. 435–438
32. М.А. Кузнецова, Б.Е. Козловский, М.П. Бекетова, Е.А. Соколова, О.П. Малюченко, Я.И. Алексеев, Е.В. Рогозина, Э.Е. Хавкин «Фитопатологическая и молекулярная характеристика изолятов Phytophtorainfestans, собранных с устойчивых генотипов картофеля», Микология и фитопатология, 2015, том 49 (в печати)
33. Марзанов Н.С., Комкова Е.А., Малюченко О.П., Алексеев Я.И., Озеров М.Ю., Кантанен Ю, Лобков В.Ю., Марзанова Л.К., Астафьева Е.Е., Петров С.Н., Колпаков И.Н., Андрюхин А.П., Адамян К.К., Марзанова С.Н. Характеристика аллелофонда Романовской породы овец по различным типам генетических маркеров. Проблемы биологии продуктивных животных, 2015, № 2, С. 23-40.
34. Заборова В.А., Арзуманян В.Г., Глоба А.Г., Алексеев Я.И., Гуридов А.А., Гуревич К.Г. Способ количественного определения видового состава пропионовых бактерий, обитающих на коже человека. Патент на изобретение № 2542477 от 21.01.2015 г.
35. Онищенко Г.Г, Петров А.А., Казанцев А.В., Суровяткин А.В., Коконова М.С., Лебедев В.Н., Алексеев Я.И., Варламов Д.А., Кутаев Д.А., Вахнов Е.Ю., Борисевич С.В. Молекулярно-генетическая характеристика рнк энтеровируса человека, выявленной в биопробе от ребенка, больного серозным менингитом, Клиническая лабораторная диагностика, 2014, N 12.-С.44-47.
36. Моисеева М.В. Разработка наборов реагентов для выявления ДНК генетически модифицированной кукурузы линий 5307 и MON89034 методом полимеразной цепной реакции в реальном времени/ М.В. Моисеева, E.Ю. Букина, Я.И. Алексеев, Е.В. Беленович, О.В. Кузубова, Д.А. Варламов, Е.С. Мазурин, П.Н. Харченко // Известия ТСХА. — 2015. —Вып.6. — С. 108 −116.
