Центр коллективного пользования научным оборудованием ВНИИСБ «Биотехнология»

Создан на базе Всероссийского научно-исследовательского института сельскохозяйственной биотехнологии Россельхозакадемии в 2008 году.

Работы выполняются при финансовой поддержке Минобрнауки РФ
Соглашение №14.621.21.0003 от 15.08.2014 г.
Номер проекта: RFMEFI62114X0003

Контакты

Адрес: г. Москва, ул. Тимирязевская, 42.
E-mail: iab@iab.ac.ru, ckp@iab.ac.ru
Тел. +7 (499) 977-7455

Руководитель ЦКП

к.б.н., Никулин Артем Валерьевич
E-mail: ckp@iab.ac.ru

Сотрудники:

  • с.н.с., к.х.н., Ермакова Наталия Владимировна
  • с.н.с. Варламов Дмитрий Александрович
  • н.с. Волков Михаил Евгеньевич
  • н.с. Боровская Светлана Владимировна
  • м.н.с. Секридова Александра Владимировна
  • м.н.с. Парыгина Наталья Андреевна

Основные направления деятельности:

  1. Обеспечение профильных организаций услугами в области анализа биологических молекул, прежде всего – нуклеиновых кислот и ферментов нуклеинового обмена с использованием уникального оборудования, наборов реагентов и методик ЦКП.
  2. Обучение специалистов современным методам анализа биологических объектов на оборудовании ЦКП.
  3. Проведение научно-исследовательских работ, опытно-конструкторских работ, направленных на:
    • получение новых знаний в области наук о жизни;
    • разработку и внедрение новых технологий анализа биологических объектов;
    • разработку и производство наборов реагентов для диагностики возбудителей социально-значимых заболеваний;
    • создание новых уникальных услуг;
    • снижение себестоимости имеющихся услуг, за счёт разработки современного высокопроизводительного научного оборудования, уникальных наборов реагентов и расходных материалов.

Приоритетные научные задачи, на решение которых ориентирован ЦКП:

Услуги:

  • Химический синтез олигонуклеотидов – ДНК, РНК, широкого спектра модифицированных олигонуклеотидов (более 50 модификаций, включая уникальные).
  • Секвенирование ДНК – плазмиды, ПЦР-фрагменты, геномное секвенирование.
  • Высокопроизводительное генотипирование - идентификация личности, различных видов животных и сортов растений, водорослей, грибов и бактерий.
  • Фрагментный анализ ДНК.
  • Сиквенс «всё включено».
  • Сиквенс «эконом».
  • Видовая идентификация бактерий.
  • Видовая идентификация эукариотических микроорганизмов (водорослей и грибов).
  • Диагностика вирусных и бактериальных возбудителей заболеваний растений, вироидов и нематод.
  • Проведение качественного и количественного анализа методом ПЦР в реальном времени.
  • Разработка наборов реагентов для ПЦР в реальном времени – изучение экспрессии генов, уникальная методика детекции однонуклеотидных полиморфизмов с использованием аллель-специфичных зондов.
  • Промышленное производство наборов реагентов на аппаратно-технологической линии, сертифицированной по ГОСТ ИСО 9001- 2011.
  • Производство диагностических наборов реагентов в условиях, отвечающих стандарту ИСО/МЭК 9001.
  • Разработка современного оборудования для анализа биологических объектов – приборов для ПЦР в реальном времени, автоматических ДНК-секвенаторов, автоматических систем выделения нуклеиновых кислот на магнитных частицах (уникальная методика синтеза покрытых силикой магнитных частиц с повышенной сорбционной ёмкостью), роботизированных станций.
  • Проведение спектрофотометрического и спектрофлуориметрического анализа на уникальном оборудовании ЦКП.
  • Проведение анализа широкого спектра соединений методом высокоэффективной жидкостной хроматографии (обращено-фазовая ВЭЖХ, ион-парная ВЭЖХ, ион-обменная ВЭЖХ).
  • Проведение анализа продуктов питания и сырья на содержание в них генетически модифицированных организмов с использованием собственных уникальных наборов реагентов для качественного и количественного анализа ГМО (25 уникальных наборов – самый широкий перечень в России).
  • Препаративная очистка биоорганических молекул на хроматографе Reveleris Prep/Grace (США)


Обучение на базе ЦКП:

  • Обучение современным методам анализа биологических объектов с использованием уникального оборудования и методик ЦКП.
    — выделение ДНК из различных объектов;
    — метод ПЦР в реальном времени;
    — технология качественного и количественного анализа ГМО;
    — технология определения сырьевого состава мясных продуктов;
    — технология «Фитоскрин» (диагностика вирусных и бактериальных заболеваний растений);
    — определение однонуклеотидных полиморфизмов (SNP) методом ПЦР-РВ;
    — обучение секвенированию ДНК.
  • Проведение курсов повышения квалификации (стажировок) для сотрудников заинтересованных организаций.
  • Выполнение дипломных, курсовых и кандидатских работ на базе ЦКП.

Загрузить официальный бланк заявки на проведение работ


Перечень имеющихся методик/методов выполнения измерений

Дорогостоящее оборудование ЦКП:

Оборудование Страна Кол-во Характеристики
Система очистки воды MilliQ Advantage Германия 2 Степень очистки воды – тип I по ASTM;
Удельное сопротивление воды после очистки при 25°С – 18,2 МОм/см;
Производительность регулируется – до 2 л/мин;
Мощность – 160 Вт
Геномный секвенатор MiSeq Illumina США 1 Количество проточных ячеек – 1;
Максимальное количество генетической информации за запуск прибора – более 1,7 миллиарда пар оснований ДНК;
Длина прочтения – до 2 х 150 пар оснований;
Монитор – сенсорный;
Светоизлучающий диод (LED) – 530 нм, 660 нм
Автомат для мойки и дезинфекции PG8535 Германия 1 Максимальное количество программ – 64;
Нагрев – 9 кВт;
Циркуляционный насос, Qмакс – 400 л/мин;
Мощность циркуляционного насоса – 0,7 кВт;
Высота моечной камеры – 500 мм;
Ширина моечной камеры – 535 мм;
Глубина моечной камеры: верхняя корзина – 473 мм, нижняя корзина – 516 мм;
Мощность вентилятора – 0,3 кВт;
Регистр нагрева – 2,3 кВт;
Производительность по воздуху – 55 м³/час;
Настройка температуры с шагом 1ºС – 60-115;
Настройка времени с шагом 1 мин. 1-240
Прибор для ПЦР-РВ CFX-96 BioRad США 1 Объем реакционной смеси – 1-50 мкл;
Максимальная скорость изменения температуры – 5 ˚C/сек;
Точность поддержания температуры – +/-0,2 ˚С;
Количество каналов – 6;
Крышка – нагреваемая до 105°С;
Возбуждение – 6 светодиодов (450-684 нм);
Детекция – 6 фотодиодов (515-730 нм);
Диапазон возбуждения/детекции флюоресценции – 450-730 нм
Лиофильная сушка AdVantage ES США 1 Контролируемый температурный диапазон полок – от -50°C до +60°C;
Мин. температура конденсора – -53°C;
Вместимость конденсора – 3.5 литра;
Производительность конденсора – 2 литра;
Кол-во компрессоров – 1;
Время охлаждения полок от +20°C до -45°C – не более 60 минут;
Размер полок – 273 х 356 х 19 мм;
Вместимость камеры (кол-во флаконов) – 100 мл - 32 шт, 50 мл - 47 шт, 20 мл - 87 шт, 10 мл - 138 штм, 5 мл - 168 шт, 2 мл - 420 шт
Система для флэш-хроматографии GRACE Reveleris США 2 Синхронизация детекции и сбора фракций с использованием до четырех сигналов детекторов (ELSD/UV/Vis);
Распознавание широкого спектра соединений;
Максимальное восстановление благодаря использованию не более чем 50 мкл/мин вашего образца для ELSD;
До 200 мл/мин и 14 бар (200 psi)
Генетический анализатор Нанофор 05 Россия 2 Количество капилляров 8;
Формат планшета 96 x 0,2 мл
Детектор – флуориметрический 6-ти канальный в диапазоне длин
волн 520-750 нм;
Лазер – твердотельный, длина волны 488 нм;
Напряжение – до 20 кВ
Контроль температуры капилляров в диапазоне 30-60 (±0,2), °С
Автоматический синтезатор ДНК/РНК ASM-10 Россия 1 Масштаб синтеза – 20-500 микромоль;
Рабочий объем реакционных колонок – 2-20 мл;
Время цикла ДНК синтеза – 10-20 мин;
Количество емкостей для мономеров – 8 шт. (A,C,G,T, и 4 — дополнительно); Количество емкостей для вспомогательных реактивов – 8 шт.;
Онлайн мониторинг синтеза по тритилу;
Контроль давления подачи газа и реагентов;
Вибрационная система перемешивание реактивов в колонке;
Автоматическое исполнение операции Cleavage;
Рабочий газ: Гелий или Аргон
Масс-спектрометр Microflex LRF Германия 1 Ионный источник с ИК-лазером для автоматической очистки;
Безмасляная вакуумная система;
Cамодиагностика основных блоков
Лиофильная сушка 4х5х8/30, Zirbus Германия 1 Конденсатор льда:
Объём – 75-120 литров;
Размер – диаметр от 400 до 500 мм, высота 600 мм;
Выработка – от 15 до 40 кг льда;
Температура – -55 градусов (одноступенчатое охлаждение), -88 градусов (двухступенчатое);
Размораживание – с помощью пара или отключение от сети;
Камера нагрева:
Объём – 160 литров;
Размер полок – 400 х 500 мм;
Температурный режим от -44/-55 до +80 градусов
Хроматограф Gilson 305/306 США 1 Скорость потока – 0.01-10 мл/мин;
Максимальное давление – 600 бар;
Одноплунжерная подача с быстрым перезаполнением;
Диапазон длин волн – 190-700 нм;
Чувствительность – 0.001-2 AUFS;
Детектирование на одной длине волны;
Детектирование на двух длинах волн;
Получение спектра (сканирование)
Люминесцентный электронный спектрометр LS55 Perkin Elmer США 1 Однолучевой люминесцентный спектрометр, работающий в режимах флуоресценции, фосфоресценции, хеми- или биолюминесценции;
Источник – 150 Вт ксеноновая лампа, работающая в пульсирующем режиме с частотой 50 Гц;
Область длин волн – возбуждение 200-800 нм, эмиссия 200-900 нм;
Спектральная ширина щели – возбуждение 2,5-1,5 нм; эмиссия 2,5-20нм; инкремент 0,1 нм;
Скорость сканирования – 10-1500 нм/мин
Анализатор молекул ДНК ABI Prizm 3130xl США 2 Оптическая система однолучевой лазер. Длина волны – 505 нм;
Напряжение – от 100 вольт до 20 киловольт;
Автозагрузчик образцов – 96 или 384 луночный планшет;
Длины капилляров – 36, 50 см
Количество капилляров – 8
Автоматический ДНК/РНК синтезатор ASM-1000 Россия 2 Производительность – 96 олигонуклеотидов;
Масштаб синтеза – от 10 до 1000 наномоль;
Длина синтезируемых олигонуклеотидов – до 150 мономеров;
Рабочие газы: Гелий и Аргон
Спектрофотометр (NanoPhotometer) Германия 1 Диапазон измеряемой концентрации - двухцепочечной ДНК – от 2 до 18 750 нг/мкл;
Диапазон измерения оптической плотности, А (эквивалент 10 мм) - 0,05-375;
Объем образца – от 0,3 мкл;
Длина оптического пути в капле - 0,04-2 мм (0,04 мм, 0.1 мм, 0.2 мм, 1 мм и 2 мм);
Спектрофотометр ND-8000 США 1 Рабочий объем образца – 1 мкл;
длина оптического пути – 0,2 и 1 мм;
диапазон длин волн – 220-750 нм;
диапазон измерения – оптическая плотность, А (экв. 10 мм) - 0,05-75;
количество образцов – до 8;
световая индикация рабочего ряда в планшете;
Прибор для ПЦР-РВ АНК Россия 1 диапазон температур – от 4 до 99°С;
разброс температур по лункам – ± 0,15°С;
погрешность температуры в лунке в диапазоне от 40 до 95 °С, °С ± 0,1; скорость нагревания не менее – 5,0°С в секунду;
скорость охлаждения не менее – 5,0°С в секунду;
количество каналов детекции – от 5 до 8;
источник света – светодиод;
детектор света – ФЭУ

Сведения о метрологическом обеспечении:

  • Средства измерения ЦКП:
    — Приборы для ПЦР в реальном времени АНК
    — Весы
    — рН-метр
    — Дозаторы
  • Свидетельства о поверке и сертификаты калибровки
  • Свидетельства об утверждении типа средств измерения

Свидетельства о поверке и сертификаты калибровки:

Выполняемые проекты:

Документы ЦКП «Биотехнология»:

Публикации сотрудников ЦКП:

Публикации, результаты которых получены с использованием научного оборудования ЦКП «Биотехнология»:

Партнеры


























События