Группа геномной модификации

Руководитель группы: чл.-корр. РАН, профессор, доктор биологических наук Ванюшин Борис Федорович
тел. (499) 976 83 11; факс (499) 977 09 47; e-mail: bfvan@iab.ac.ru


Сотрудники

— Федореева Л.И., в.н.с., д.б.н.
— Смирнова Т.А., в.н.с., к.б.н.
— Диловарова Т.А., с.н.с., к.б.н.

Основное направление исследований

Изучение эпигенетических систем растений (характер метилирования генома и свойства специфических ферментов - ДНК-метилтрансфераз и эндонуклеаз).

Исследовательская работа ведется в рамках программы «Живые системы», поддержана несколькими грантами РФФИ и Президентским грантом «Ведущие научные школы».

Основные научные достижения.

У растений открыто адениновое метилирование ДНК. Из проростков пшеницы выделены и охарактеризованы первая эукариотическая адениновая ДНК-метилтрансфераза и новая уникальная эндонуклеаза WEN1. Фермент WEN1 различает ДНК по статусу их метилирования, активируется универсальным донором метильных групп S-аденозил-L-метионином и модулируется белком хроматина – гистоном Н1. Таким образом, открыт новый тип регуляции активности эукариотических (растительных) эндонуклеаз. Фермент WEN1 может быть использован в генной инженерии и для исследования эпигенетических систем растений.

Работы удостоены премии им. А.Н. Белозерского РАН (2004 г.) 

Избранные публикации

Vanyushin B.F., Bakeeva L.Е., Zamyatnina V.A., Aleksandrushkina N.I. Apoptosis in plants: specific features of plant apoptotic cells and effect of various factors and agents. International Review of Cytology (A Survey of Cell Biology), 233, 135-179 (2004).

Veselova T.V., Veselovsky V.A., Turovetsky V.B, Galchuk S.V., Vanyushin B.F. Aleksandrushkina N.I., Rubin A.B. Post-hypoxic oxidative stress after radicle protrusion as a possible cause for the production of abnormal seedlings in pea. Seed Sci. Technol., 32, 283-296 (2004).

Ванюшин Б.Ф. Материализация эпигенетики, или небольшие изменения с большими последствиями. Химия и жизнь, № 2, 32-37 (2004).

Александрушкина Н.И., Замятнина В.А., Бакеева Л.Е., Середина А.В., Смирнова Е.Г., Ягужинский Л.С., Ванюшин Б.Ф. Апоптоз у проростков пшеницы при нормальном световом дне. Биохимия, 69, 356-366 (2004).

Смирнова Т.А., Прусов А.Н., Коломийцева Г.Я., Ванюшин Б.Ф. Гистон Н1 в развивающемся и стареющем колеоптиле у этиолированных проростков пшеницы. Биохимия, 69, 1387 - 1395 (2004).

Романов Г.А., Ракова Н.Ю., Ванюшин Б.Ф. Полиамины подавляют экспрессию цитокининзависимого трансгена у арабидопсиса. Доклады РАН, 398, 415-418 (2004).

Ванюшин Б.Ф. Энзиматическое метилирование ДНК – эпигенетический контроль за генетическими функциями клетки. Биохимия, 70, 598-611 (2005).

Ванюшин Б.Ф. Метилирование адениновых остатков в ДНК эукариот. Молекулярная биология, 39, 557-566 (2005).

Ванюшин Б.Ф. ВНИИ сельско-хозяйственнной биотехнологии и его вклад в разработку современных биотехнологических методов. Сельскохозяйственная биология, №1, 101-103 (2005).

Vanyushin B.F. DNA methylation in plants. Current Topics Microbiol. Immunol., 301, 67-122 (2006).

Ванюшин Б.Ф. Метилирование ДНК и эпигенетика. Генетика, 42, № 9, 1-14 (2006).

Смирнова Т.А., Коломийцева Г.Я., Прусов А.Н., Ванюшин Б.Ф. Содержание цинка и меди в развивающемся и стареющем колеоптиле проростков пшеницы. Физиология растений, 53, 597-603 (2006).

Fedoreyeva L.I., Sobolev D.E., Vanyushin B.F. Wheat endonuclease WEN1 dependent on S-adenosyl-L-methionine and sensitive to DNA methylation status. Epigenetics, 2, № 1, 50-53 (2007).

Романов Г.А., Наумкина Е.М., Ашапкин В.В., Ванюшин Б.Ф. Метилирование GCGG-сайтов пататинового промотора органоспецифично и обратно коррелирует с его активностью. Докл. РАН 47, № 3, 410-413 (2007).

Ванюшин Б.Ф. Пристальный взляд стихийного натуралиста на мир ДНК (нуклеотидный состав, последовательности, метилирование). Биохимия, 72, 598-1608 (2007).

Александрушкина Н.И., Коф Э.М., Середина А.В., Борзов А.А., Ванюшин Б.Ф. Связанные со старением деградация ДНК и эндонуклеазная активность в листьях гороха нормального и афильного генотипов. Физиология растений, 55, 1-10 (2008).

Федореева Л.И., Соболев Д.Е., Ванюшин Б.Ф. S-аденозил-L-метионинзависимая и чувствительная к статусу метилирования ДНК эндонуклеаза WEN2 из колеоптилей пшеницы. Биохимия, 73, 1243-1251 (2008).

Федореева Л.И, Смирнова Т.А., Коломийцева Г.Я., Ванюшин Б.Ф. Гистон Н1 модулирует гидролиз ДНК эндонуклеазами WEN1 и WEN2 из колеоптилей пшеницы. Биохимия, 74, № 2, 181-189 (2009).

Александрушкина Н.И., Середина А.В., Ванюшин Б.Ф. Активность эндонуклеаз в колеоптиле и первом листе развивающихся этиолированных проростков пшеницы. Физиология растений, 56, № 2, 1-11 (2009).

Александрушкина Н.И., Ванюшин Б.Ф. Эндонуклеазы и их участие в апоптозе растений. Физиология растений, 56, № 3, 11-17 (2009).

Pogribny I.P., Vanyushin B.F. Age-related genomic hypomethylation. Chapter in a Book, T.O. Tollefsbol (ed.), Epigenetics of Aging, DOI 10.1007/978-1-4419-0639-7_2, C, Springer Science+Business Media, LLC, p. 11-27 (2010).

Vanyushin B.F., Ashapkin V.V. DNA Methylation in Plants. Nova Biomedical Books. Nova Science Publishers Inc., New York, pp. 1-152 (2010). Монография.

Федореева Л.И., Ванюшин Б.Ф. CNG сайт-специфичная метил-чувствительная эндонуклеаза WEN1 из проростков пшеницы //Биохимия. 2011. Т. 76. № 6. С. 799-807.

Khavinson V.K., Fedoreeva L.I., Vanyushin B.F. Short peptides modulate the effect of endonucleases of wheat seedling //Doklady Biochemistry and Biophysics. 2011. Т. 437. № 1. С. 64-67.

Fedoreyeva L.I., Vanyushin B.F., Kireev I.I., Khavinson V.Kh. Penetration of short fluorescence-labeled peptides into the nucleus in hela cells and in vitro specific interaction og the peptides with deoxyribooligonucleotides and DNA // Biochemistry (Moscow). 2011. Т. 76. № 11. С. 1210-1219.

Fedoreyeva L.I., Vanyushin B.F. Processing character of the action of wheat endonucleases WEN1 and WEN2. Kinetic parameters // Biochemistry (Moscow). 2012. Т. 77. № 5. С. 485-491.

Федореева Л.И., Смирнова Т.А., Коломийцева Г.Я., Хавинсон В.Х., Ванюшин Б.Ф. Взаимодействие коротких пептидов с FITC – мечеными гистонами пшеницы и их комплексами с дезоксирибоолигонуклеатидами //Биохимия. 2013. Т. 78. № 2. С. 230-242.

В. Ашапкин, Н. Линькова, В. Хавинсон, Б. Ванюшин Эпигенетические механизмы пептидергической регуляции экспрессии генов при старении клеток человека // Biochemistry (Moscow). — 2015. — Т. 80, № 3. — С. 374–388.

Vladimir Khavinson, Vasily Ashapkin, Galina Ryzhak, Natalya Linkova, Svetlana Tarnovskaya, Valery Benberin, Boris Vanyushin. Biologically active peptide geroprotectors a as epigenetic modulators of gene activity //Irish Ageing Studies Review. - 2015. - Issue 1. - №6, 313-314

Vanyushin B.F. Enzymatic DNA methylation: what it is needed for in the cell. JSM Genetics & Genomics, 3, 1010 (2016).

Vanyushin B.F., Khavinson V.Kh. Short Biologically Active Peptides as Epigenetic Modulators of Gene Activity. In: Epigenetics - A Different Way of Looking at Genetics (Eds. W.Doerfler, P. Bohm), Epigenetics and Human Health, Springer, P. 69-90 (2016). Ашапкин В.В., Кутуева Л.И., Ванюшин Б.Ф. Эпигенетическая изменчивость у растений: наследуемость, адаптивность, эволюционное значение. Физиология растений, 63, № 2, 1-14 (2016).

Ашапкин В.В., Кутуева Л.И., Ванюшин Б.Ф. Гены ДНК-метилтрансфераз растений: множественность, экспрессия, характер метилирования. Биохимия, 81, 238-250 (2016).

Ашапкин В.В., Кутуева Л.И., Ванюшин Б.Ф. Dnmt2 – самая эволюционно консервативная и загадочная цитозиновая ДНК-метилтрансфераза эукариот. Генетика, 52, № 3, 269-282 (2016).

Vanyushin B.F., Ashapkin V.V. HISTORY AND MODERN VIEW ON DNA MODIFICATIONS IN THE BRAIN.: DNA MODIFICATIONS IN THE BRAIN. 1-25, ELSEVIER (2017).

Ванюшин Б.Ф., Ашапкин В.В., Александрушкина Н.И. Регуляторные пептиды у растений // Биохимия, 2017, 82, 189-195.

Федореева Л.И., Диловарова Т.А., Ашапкин В.В., Мартиросян Ю.Ц., Хавинсон В.Х., Харченко П.Н., Ванюшин Б.Ф. Короткие экзогенные пептиды регулируют экспрессию генов семейств CLE, KNOX1 и GRF у Nicotiana tabacum // Биохимия, 2017, 82, 700-709 .

Партнеры


























События