Лаборатория молекулярной вирусологии

Заведующий лабораторией: кандидат биологических наук
Вишниченко Валерий Константинович

Тел. (499) 977-4634, e-mail: vish@iab.ac.ru

Сотрудники:


— Соловьев Андрей Геннадьевич — в.н.с., д.б.н. (планирование экспериментов, компьютерный анализ);

— Петруня Игорь Валерьевич — в.н.с., к.б.н. (конструирование праймеров, ПЦР в классическом варианте, секвенирование, иммуноблоттинг);

— Архипов Андрей Владимирович — н.с. (секвенирование, компьютерный анализ, ПЦР в классическом варианте, ПЦР в реальном времени);

— Петруня Валерия Валерьевна — лаборант-исследователь (выращивание экспериментальных растений, подготовка растительных тканей, препараты тотальной РНК, получение антисывороток).

Направления исследований.

Научные исследования в Лаборатории молекулярной вирусологии ведутся по следующим направлениям:

1. Молекулярные механизмы репродукции Х вируса шалота (ХВШ), прототипа нового рода фитовирусов — аллексивирусов. Изучаются функции вирусных белков, молекулярные механизмы их экспрессии и внутривидовой эволюции.

2. Молекулярные механизмы супрессии РНК-сайленсинга вирусами растений. При этом основной акцент сделан на выяснении механизмов индукции PTI (PAMP-triggered immunity) и транскрипционного репрограммирования в процессе персистентной аллексивирусной инфекции. В соответствии с такой постановкой проблемы в

Лаборатории исследуется также структура вирусных двухцепочечных РНК и выясняется природа внутриклеточных рецепторов (сенсоров) репликативных форм вирусной геномной РНК.

Основные научные достижения

1. Открыт новый РНК-содержащий нитевидный фитовирус — Х вирус шалота (ХВШ, ShVX) — и обосновано выделение нового рода фитовирусов — аллексивирусов (Allexivirus), включающего ХВШ в качестве прототипа.
2. Секвенирован геном ХВШ и получена полноразмерная инфекционная кДНК-копия его геномной РНК.
3. Открыт и исследован феномен органоспецифической экспрессии гена капсидного белка ХВШ.
4. Обнаружен новый штамм вируса, отличающийся от классического протяженным блоком мутаций в первой трети N-концевого фрагмента молекулы капсидного белка. Эти мутации обусловливают открытый в Лаборатории феномен морфологической гетерогенности капсида ХВШ.
5. Показано, что уникальный 42К-белок ХВШ принимает участие в формировании вирионов ХВШ.
6. Исследованы закономерности накопления мутаций в геноме ХВШ в результате многолетней персистентной инфекции растений шалота.
7. Доказано, что ХВШ репродуцируется в отсутствии активного белка-супрессора РНК-сайленсинга.
8. Доказано, что TGB3 — один из белков, кодируемых тройным блоком генов -транслируется с бицистронной матрицы с неканонического инициирующего кодона CUG и при участии механизма leaky scanning.
9. Показано, что в результате персистентной инфекции ХВШ индуцируется PTI (PAMP-triggered immunity) и тонко скоординированный избирательный процесс транскрипционного репрограммирования.

Основные научные публикации

1. Kanyuka KV, Vishnichenko VK, Levay KE, Kondrikov DYu, Ryabov EV, Zavriev SK. Nucleotide sequence of shallot virus X RNA reveals a 5’-proximal cistron closely related to those of potexviruses and a unique arrangement of the 3’-proximal cistrons. . J Gen Virol. 1992 Oct;73 ( Pt 10):2553-60.

2. Vishnichenko VK, Kaloshin AA, Riabov EV, Zavriev SK. Cloning of full-length cDNA of the shallots virus X genome and infectivity of its transcripts in sugar beet protoplasts. Mol Biol (Mosk). 2000 Jan-Feb;34(1):167-71.

3. Vishnichenko VK, Zavriev SK. Detection of infectious viral particles in plant protoplasts inoculated with transcripts of full-length shallot virus X cDNA. Arch Virol. 2001;146(6):1213-7.

4. Vishnichenko VK1, Stel’mashchuk VIa, Zavriev SK. The 42k protein of the shallot virus X participates in formation of the viral particles. Mol Biol (Mosk). 2002 Nov-Dec; 36(6):1080-4.

5. Arkhipov AV, Gushchin VA, Vishnichenko VK, Solovyev AG. Accumulation of changes in the genome of shallot virus X persisting in vegetatively reproduced plants. Dokl Biochem Biophys. 2013 Sep;452(1):237-40.

6. Lezzhov AA, Gushchin VA, Lazareva EA, Vishnichenko VK, Morozov SY, Solovyev AG Translation of the shallot virus X TGB3 gene depends on non-AUG initiation and leaky scanning. J Gen Virol. 2015 Oct;96(10):3159-64. doi: 10.1099/jgv.0.000248. Epub 2015 Jul 17.

7. A. V. Arkhipov, A. G. Solovyev, , and V. K. Vishnichenko. Persistent Shallot Virus X Infection Correlates with Transcriptional Repression of Plant Cell RNA-Dependent RNA Polymerase and DCL Proteins in Plant Roots. Molecular Biology, 2017, Vol. 51, No. 1, pp. 108–111.

Партнеры


























События