НОВОСТИ И ОБЪЯВЛЕНИЯ

11 февраля 2020г.

Вариация копийности мобильных элементов в геномах пырея среднего Thinopyrum Intermedium и его диплоидных сородичей

Диплоидные и полиплоидные виды Triticeae характеризуются сложными филогенетическими отношениями. Понимание их эволюции и видообразования позволит расширить возможности для их использования в селекции пшеницы в качестве источника генетического разнообразия. Диплоидные виды Pseudoroegneria spicata (St), Thinopyrum bessarabicum (Jb) и Dasypyrum villosum (V) произошли от гипотетического общего предка и, как предполагают, являются возможными донорами субгеномов гексаплоидного пырея среднего Th. intermedium (JrJvsSt, где индексы r, v, и s обозначают частичную близость этих субгеномов соответственно геномам видов Secale, Dasypyrum, и Pseudoroegneria). Нами была определена относительная копийность 10 семей мобильных элементов в геномах P. spicata, Th. bessarabicum, D. villosum (в расчёте на один геном), и Th. intermedium (в расчёте на один средний субгеном) с использованием количественной ПЦР в реальном времени. Мы сравнили копийность мобильных элементов как внутри изучаемых геномов, так и между ними. В результате наших исследований было показано, что ретротранспозон Sabrina является наиболее копийным среди всех изученных мобильных элементов в геномах P. spicata, D. villosum, и Th. Intermedium, а среди Ty3/Gypsy ретроэлементов – самым копийным у всех изучаемых видов. Среди Ty1/Copia ретроэлементов Angela-A и WIS-A продемонстрировали наиболее высокую и сопоставимую копийность во всех видах за исключением D. villosum, а также составили большую часть среди всех изученных элементов в геноме Th. bessarabicum. Sabrina, BAGY2 и Angela-A показали близкую копийность как среди диплоидных видов, так и у гексаплоида Th. intermedium; Latidu и Barbara показали значительную разницу между геномами диплоидных видов. Обсуждаются отношения между геномами видов Triticeae на основе полученных результатов копийности мобильных элементов и их роль в видообразовании и полиплоидизации в свете современных филогенетических моделей.

 Результаты опубликованы: Divashuk M.G., Karlov G.I., Kroupin P.Y. Copy number variation of transposable elements in thinopyrum intermedium and its diploid relative species // Plants. – 2020. - Volume 9. - Issue 1. - Номер статьи 15. - DOI: 10.3390/plants9010015

Партнеры


























События