Сотрудники ФГБНУ ВНИИСБ провели цитогенетические исследования отдалённых гибридов пшеницы, имеющих важное фундаментальное и прикладное значение. Промежуточные пшенично-пырейные гибриды (ПППГ) представляют интерес в качестве селекционного мостика, который используется для передачи ценных генов в геном пшеницы, а также в виде модельного объекта, который сочетает в себе геномы близкородственных видов Пшеницевых. Создание цитогенетических маркеров — это длительная и трудоёмкая процедура, требующая тестирования различных проб методом флуоресцентной гибридизации in situ (FISH) для выбора наиболее подходящей пробы. Целью исследования было найти подход, который бы упростил данный процесс. На основании данных секвенирования генома пырея понтийского (Thinopyrum ponticum) с использованием алгоритма RepeatExplorer2 мы выбрали шесть кластеров тандемных повторов и на каждый из них разработали праймеры. С помощью метода количественной ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ) мы оценили копийность найденных повторов в геномах мягкой пшеницы, пырея понтийского и пырея среднего, а также в геномах ПППГ, созданных с использованием данных видов. Также мы локализовали данные повторы на хромосомах ПППГ с помощью метода FISH. В результате на основе отобранных тандемных повторов мы создали три цитогенетических маркера, которые позволяют специфически маркировать хромосомы пырея в присутствии хромосом пшеницы. Более того, мы разработали и протестировали праймеры на эти повторы, продемонстрировав с помощью количественной ПЦР, что они могут быть использованы в селекционном процессе как ПЦР-РВ маркеры для быстрого и дешёвого мониторинга наличия определённых хромосом пырея.