Крахмал, как основное вещество в составе зерна злаков, служит главным источником калорий в продуктах питания и используется в качестве сырья для промышленности. Технологические и пищевые свойства крахмала зависят от его состава, поэтому управление его компонентами, амилозой и амилопектином, имеет большое значение. Свойства крахмала пшеничного зерна могут быть изменены за счет использования различных аллельных вариаций генов, кодирующих ферменты, участвующие в его биосинтезе, включая гранулосвязанную синтазу крахмала I (кодируется генами Waxy – сокращённо Wx). Третичный генофонд, включающий виды пырея (Thinopyrum), обеспечивает широкий спектр генов-ортологов, которые могут быть использованы для увеличения аллельного разнообразия генов пшеницы путем отдаленной гибридизации. Октаплоидные промежуточные пшенично-пырейные гибриды (амфидиплоиды, ПППГ) объединяют полный геном пшеницы мягкой (BBAADD) и смешанный геном из хромосом пырея среднего (Thinopyrum intermedium, геномный состав JrJrJvsJvsStSt) и пырея понтийского (Th. ponticum, JJJJJJJsJsJsJs). Таким образом, ПППГ могут нести гены Wx не только пшеничного (Wx-В1, Wx-А1 и Wx-D1), но и пырейного происхождения. В результате исследований, проведенных учеными ФГБНУ ВНИИСБ совместно с учеными НМИЦ ПМ, удалось оценить уровень амилозы в крахмале и изучить полиморфизм генов Wx у 12 образцов ПППГ. Кроме того, были охарактеризованы гены-ортологи Wx в геномах дикорастущих сородичей пшеницы, участвующих в формировании изученных ПППГ, Th. intermedium и Th. ponticum, а также у предполагаемых доноров их субгеномов, пырея бессарабского (Th. bessarabicum, JbJb) и пырейника ковылелистного (Pseudoroegneria stipifolia, St1St1St2St2). Хотя никаких существенных различий в содержании амилозы между различными образцами ПППГ обнаружено не было, электрофорез белков в полиакриламидном геле в присутствии додецилсульфата натрия продемонстрировал, что, по крайней мере, два ПППГ имеют дополнительную изоформу гранулосвязанной синтазы крахмала. Были секвенированы гены-ортологи Wx у Th. bessarabicum, P. stipifolia, Th. intermedium и Th. ponticum, и разработан маркер WXTH, который может различать ген Wx пырея рода Thinopyrum в окружении генома пшеницы, и локализован в хромосоме 7E у Th. elongatum. Используя маркер WXTH, стало возможным выявить аллельный полиморфизм гена Wx пырейного происхождения в исследуемых ПППГ. Обсуждается возможное применение генов Wx пырейного происхождения в селекции пшеницы и их влияние на качество крахмала.