Сотрудники ФГБНУ ВНИИСБ провели сравнительное изучение нетранскрибируемых спейсеров 5S рДНК у видов семейства Elaeagnaceae. В ходе исследования было показано, что 5S рДНК организована в виде кластера тандемно повторяющихся мономеров, которые состоят из консервативной 120 п.о. кодирующей части и нетраскрибируемых спейсеров (NTS) c различной длиной и последовательностью у различных видов. Полиморфизм NTS 5S рДНК у близкородственных видов интересен для филогенетических и эволюционных исследований, а также для разработки молекулярных маркеров. В данной работе NTS 5S рДНК были амплифицированы с помощью универсальных 5S1/5S2 праймеров у некоторых видов семейства Elaeagnaceae Adans. Продукты ПЦР пяти видов Elaeagnus имели сходную длину около 310 п.о. и отличались от образцов Shepherdia canadensis (L.) Nutt. и Sh. argentea (Pusch.) Nutt., у которых ампликоны имели длину 260 п.о. и 215 п.о., соответственно. Продукты ПЦР были клонированы и секвенированы. Анализ последовательностей показал, что внутривидовой уровень идентичности был высокий (около 95%—96%) и сходный у видов Elaeagnus L. У Sh. argentea этот уровень был значительно ниже из-за различий внутри поли-Т региона. Кроме того, межвидовой и межсортовой уровни идентичности NTS были изучены и сравнены. Существенные различия между видами (за исключением E. multiflora Thunb. и E. umbellata Thunb.) и родами были найдены. Также ряд особенностей NTS были обсуждены. Данная работа может быть полезна для разработки видоспецифичных маркеров в этом семействе.

Данные опубликованы: Alexandrov O.S., Razumova O.V., Karlov G.I. A comparative study of 5s rdna non-transcribed spacers in elaeagnaceae species //Plants. — 2021. -Volume 10. — Issue 1. — Номер статьи 4. — Pages 1-11. — DOI: 10.3390/plants10010004