Выведение новых, более продуктивных сортов сельскохозяйственных культур становится все более сложной задачей. Современные подходы к идентификации полезных аллелей и их использованию в элитных сортах, такие как картирование локусов количественных признаков (QTL) и селекция с помощью маркеров (MAS), эффективны, но недостаточны для того, чтобы поддерживать высокий темп улучшения пшеницы и других культур. Метаболомика — мощный, но пока малоиспользуемый подход, который может помочь селекции сельскохозяйственных культур. Сотрудники ФГБНУ ВНИИСБ обобщили основную методологическую информацию и на недавних примерах рассмотрели текущие стратегии применения метаболомики, связанные с селекцией сельскохозяйственных культур. Были кратко описаны классы метаболитов растений, клеточная локализация метаболических путей, а также сильные и слабые стороны метаболомики. В базе данных коммерциализированных генетически модифицированных культур International Service for the Acquisition of Agri‐biotech Applications (ISAAA) сейчас находится около 50 различных метаболически измененных растений. Эти растения рассматриваются как примеры применения знаний о биохимических путях. Основываясь на недавних исследованиях, была обсуждена эффективность метаболических маркеров, интеграция метаболомных и геномных данных в метаболические QTL (mQTL) и метаболические геномные ассоциации (mGWAS). Был сделан вывод, что выяснение метаболических путей и вовлеченных генов должно помочь в селекции сельскохозяйственных культур, в том числе, в более целенаправленной интрогрессии аллелей диких родственников.